Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms