Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RptnP97347 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RptnP97347 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RptnP97347 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RptnP97347 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RptnP97347 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RptnP97347 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RptnP97347 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RptnP97347 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RptnP97347 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RptnP97347 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RptnP97347 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RptnP97347 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RptnP97347 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms