Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TfamP40630 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TfamP40630 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TfamP40630 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TfamP40630 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TfamP40630 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms