Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnga1P29974 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga1P29974 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms