Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3aP28741 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Kif3aP28741 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms