Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prf1P10820 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prf1P10820 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms