Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chrnb1P09690 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb1P09690 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms