Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms