Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms