Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms