Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms