Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsc22d3Q9Z2S7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsc22d3Q9Z2S7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms