Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Mbd3Q9Z2D8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Mbd3Q9Z2D8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Mbd3Q9Z2D8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Mbd3Q9Z2D8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mbd3Q9Z2D8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Mbd3Q9Z2D8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Mbd3Q9Z2D8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Mbd3Q9Z2D8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Mbd3Q9Z2D8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Mbd3Q9Z2D8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mbd3Q9Z2D8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mbd3Q9Z2D8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mbd3Q9Z2D8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Mbd3Q9Z2D8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Mbd3Q9Z2D8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mbd3Q9Z2D8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mbd3Q9Z2D8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Mbd3Q9Z2D8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Mbd3Q9Z2D8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms