Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HnrnpcQ9Z204 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpcQ9Z204 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpcQ9Z204 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpcQ9Z204 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HnrnpcQ9Z204 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HnrnpcQ9Z204 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HnrnpcQ9Z204 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms