Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VarsQ9Z1Q9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VarsQ9Z1Q9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VarsQ9Z1Q9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VarsQ9Z1Q9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VarsQ9Z1Q9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VarsQ9Z1Q9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VarsQ9Z1Q9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms