Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfs1Q9Z1J3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfs1Q9Z1J3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfs1Q9Z1J3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfs1Q9Z1J3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfs1Q9Z1J3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfs1Q9Z1J3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfs1Q9Z1J3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfs1Q9Z1J3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nfs1Q9Z1J3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Nfs1Q9Z1J3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nfs1Q9Z1J3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfs1Q9Z1J3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfs1Q9Z1J3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfs1Q9Z1J3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfs1Q9Z1J3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfs1Q9Z1J3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1658.7 ms