Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsig2Q9Z109 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsig2Q9Z109 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vsig2Q9Z109 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsig2Q9Z109 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsig2Q9Z109 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms