Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cib1Q9Z0F4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cib1Q9Z0F4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cib1Q9Z0F4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cib1Q9Z0F4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cib1Q9Z0F4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cib1Q9Z0F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cib1Q9Z0F4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cib1Q9Z0F4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cib1Q9Z0F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cib1Q9Z0F4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cib1Q9Z0F4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cib1Q9Z0F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib1Q9Z0F4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib1Q9Z0F4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cib1Q9Z0F4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cib1Q9Z0F4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms