Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms