Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfwd2Q9R1A8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfwd2Q9R1A8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfwd2Q9R1A8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfwd2Q9R1A8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfwd2Q9R1A8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfwd2Q9R1A8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms