Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc1Q9QZF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc1Q9QZF2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc1Q9QZF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc1Q9QZF2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc1Q9QZF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc1Q9QZF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc1Q9QZF2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms