Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hacd1Q9QY80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd1Q9QY80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd1Q9QY80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hacd1Q9QY80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hacd1Q9QY80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms