Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chaf1aQ9QWF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chaf1aQ9QWF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chaf1aQ9QWF0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Chaf1aQ9QWF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chaf1aQ9QWF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chaf1aQ9QWF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chaf1aQ9QWF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chaf1aQ9QWF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms