Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hdgfl3Q9JMG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl3Q9JMG7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl3Q9JMG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms