Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc4apQ9JLV2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc4apQ9JLV2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc4apQ9JLV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc4apQ9JLV2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc4apQ9JLV2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4apQ9JLV2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc4apQ9JLV2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc4apQ9JLV2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc4apQ9JLV2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc4apQ9JLV2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc4apQ9JLV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc4apQ9JLV2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc4apQ9JLV2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms