Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf19Q9JLL3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf19Q9JLL3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms