Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem1Q9JKE2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trem1Q9JKE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem1Q9JKE2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Trem1Q9JKE2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trem1Q9JKE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms