Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpa33Q9JKA5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpa33Q9JKA5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpa33Q9JKA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpa33Q9JKA5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpa33Q9JKA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms