Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tuba8Q9JJZ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba8Q9JJZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba8Q9JJZ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba8Q9JJZ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba8Q9JJZ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms