Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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