Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ClpxQ9JHS4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClpxQ9JHS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClpxQ9JHS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpxQ9JHS4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpxQ9JHS4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpxQ9JHS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms