Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copz2Q9JHH9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copz2Q9JHH9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Copz2Q9JHH9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz2Q9JHH9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz2Q9JHH9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz2Q9JHH9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copz2Q9JHH9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copz2Q9JHH9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms