Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem27Q9ESG4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem27Q9ESG4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem27Q9ESG4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem27Q9ESG4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem27Q9ESG4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem27Q9ESG4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem27Q9ESG4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms