Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufa13Q9ERS2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa13Q9ERS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa13Q9ERS2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa13Q9ERS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa13Q9ERS2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa13Q9ERS2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms