Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lima1Q9ERG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lima1Q9ERG0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lima1Q9ERG0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lima1Q9ERG0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lima1Q9ERG0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lima1Q9ERG0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lima1Q9ERG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lima1Q9ERG0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lima1Q9ERG0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lima1Q9ERG0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lima1Q9ERG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lima1Q9ERG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms