Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb3Q9ERD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb3Q9ERD7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb3Q9ERD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb3Q9ERD7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb3Q9ERD7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms