Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dap3Q9ER88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dap3Q9ER88 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dap3Q9ER88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dap3Q9ER88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dap3Q9ER88 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dap3Q9ER88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms