Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bap18Q9DCT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bap18Q9DCT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bap18Q9DCT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bap18Q9DCT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bap18Q9DCT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bap18Q9DCT6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bap18Q9DCT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bap18Q9DCT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms