Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelenooQ9DBC0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SelenooQ9DBC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SelenooQ9DBC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SelenooQ9DBC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SelenooQ9DBC0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SelenooQ9DBC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SelenooQ9DBC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SelenooQ9DBC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SelenooQ9DBC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SelenooQ9DBC0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SelenooQ9DBC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SelenooQ9DBC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SelenooQ9DBC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms