Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco5aQ9D9D5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco5aQ9D9D5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco5aQ9D9D5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5aQ9D9D5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmco5aQ9D9D5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5aQ9D9D5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5aQ9D9D5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms