Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms