Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8M3

Slc48a1, Heme transporter HRG1, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc48a1Q9D8M3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc48a1Q9D8M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc48a1Q9D8M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc48a1Q9D8M3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc48a1Q9D8M3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc48a1Q9D8M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc48a1Q9D8M3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc48a1Q9D8M3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc48a1Q9D8M3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms