Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4ipQ9D7Y9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4ipQ9D7Y9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx4ipQ9D7Y9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx4ipQ9D7Y9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4ipQ9D7Y9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx4ipQ9D7Y9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4ipQ9D7Y9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4ipQ9D7Y9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4ipQ9D7Y9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx4ipQ9D7Y9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx4ipQ9D7Y9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms