Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kctd4Q9D7X1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd4Q9D7X1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kctd4Q9D7X1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kctd4Q9D7X1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd4Q9D7X1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd4Q9D7X1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kctd4Q9D7X1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd4Q9D7X1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms