Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp4cQ9D7F7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chmp4cQ9D7F7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chmp4cQ9D7F7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chmp4cQ9D7F7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chmp4cQ9D7F7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms