Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D7E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D7E4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D7E4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D7E4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D7E4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D7E4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D7E4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D7E4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D7E4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D7E4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D7E4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms