Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnfsf13Q9D777 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13Q9D777 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf13Q9D777 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfsf13Q9D777 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfsf13Q9D777 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfsf13Q9D777 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms