Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Exosc8Q9D753 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc8Q9D753 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exosc8Q9D753 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc8Q9D753 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Exosc8Q9D753 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms