Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23bQ9D662 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23bQ9D662 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23bQ9D662 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23bQ9D662 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec23bQ9D662 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23bQ9D662 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms