Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V1

Actl11, Actin-like 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl11Q9D5V1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actl11Q9D5V1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actl11Q9D5V1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actl11Q9D5V1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actl11Q9D5V1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actl11Q9D5V1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actl11Q9D5V1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actl11Q9D5V1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actl11Q9D5V1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actl11Q9D5V1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actl11Q9D5V1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms